Hoe komt het eigenlijk dat grondwater meestal al heel goed gezuiverd is van allerlei verontreinigingen?

Omdat de grond werkt als een uitstekend filter. Alle "normale" eventuele verontreinigingen blijven in de bovengelegen grondlagen steken, en het grondwater dat je oppompt is in de regel heel zuiver.
Overigens werken waterzuiveringsbedrijven niet op een heel erg andere manier ; ook daar worden zand- kool- en steensoorten en bacteriën gebruikt om het water te zuiveren voor hergebruik.