Welke technieken kun je gebruiken om DNA te vergelijken?

Ik zou zeggen dat je drie basistechnieken hebt, maar ik ben absoluut geen moleculair bioloog.

Je hebt DNA profielen, die gebaseerd zijn op het knippen van stukken DNA waarin zogenaamde microsatellieten voorkomen. De DNA brokstukken kunnen dan vermenigvuldigd worden met behulp van PCA, zodat je zichtbare hoeveelheden DNA krijgt. Het DNA gaat dan op een gel en wordt door middel van elektriciteit in allerlei fracties gescheiden. Vervolgens moeten de bandjes worden gekleurd. Verschillende personen geven verschillende bandjespatronen. Het is een techniek die niets zegt over iemands erfelijke eigenschappen, het is meer te vergelijken met een genetische vingerafdruk.

Dan is er DNA sequencing, daarbij wordt het totaal aan genetische informatie van organismen geanalyseerd. Dat levert enorme hoeveelheden data op met de aanwezige basevolgordes. Deze databases zijn weer toegankelijk voor wetenschappers en ze kunnen die informatie gebruiken om allerlei interessante overeenkomsten tussen organismen te vinden. Dit gaat heel erg om functionele genen, die in allerlei organismen voorkomen. Het is een erg gespecialiseerd vakgebied. In de bron staat hoe men relevante informatie uit de database kan halen. GenBank is een enorme database die elke 18 maanden verdubbelt, dit instrument wordt dus snel veel krachtiger, vergelijkbaar met internet en de ontwikkeling van computers

Dan is ook nog DNA hybridisatie. Je hebt een referentieorganisme (dier of plantensoort) en je kunt dan kijken of het onbekende DNA aan die referentie bindt. Het bindende deel kan vast blijven plakken en dat kun je weer vermenigvuldigen met PCA. Als het soort DNA overeenkomt weet je dat het organisme aanwezig is. Je kunt van een plas, poel of rivier meteen vaststellen of een soort waarin je geinteresseerd bent daar voorkomt. Bij exotische dieren kun je dus door wat kleine potjes water in een heel gebied snel vaststellen of de soort er al voorkomt (brulkikker bijvoorbeeld), ook voor zeldzame soorten (grote modderkruiper/kwabaal/knoflookpad) kun je snel zien of ze nog aanwezig zijn. (environmental DNA). DNA hybridisatie is wel een wat bredere techniek, maar de andere toepassingen ken ik persoonlijk niet.

Toegevoegd na 6 dagen:
Ik heb nog een link toegevoegd over wat er bij Craig Venter gaande is. De databank van Venter is nog een stuk groter dan die van GenBank, maar niet publiek toegankelijk.