Zijn er naast kerken ook gebedshuizen die 's nachts vluchtelingen opvangen?

Ja, ook moskeeën vangen hun op (zie bron).

"Probleem" bij moskeeën is dat ze op veel momenten vol zijn, zoals bijv. tijdens het vrijdagmiddag gebed, dan is er geen ruimte voor bedden, kleding, etc.

I.t.t. de Kerk, deze is over het algemeen zelfs op zondagochtend halfleeg/halfvol.

Bijkomend probleem bij een moskee is dat de vrouwen en mannen over het algemeen gescheiden worden, dit is facilitair gezien haast onmogelijk als daar vluchtelingen (hele gezinnen) gaan verblijven.