Kan ik mijn belasting overmaken aan het Europees Parlement en is dit dan aftrekbaar van mijn Nederlandse belasting?

Nee, dat gaat niet. De reden is eenvoudig. Je bent belastingen verschuldigd aan de Nederlandse staat, niet aan het Europese Parlement.

Het Europese Parlement is ook geen "regering" maar een orgaan dat de Europese Commissie moet controleren en Europese regelgeving van de Europese Commissie kan amenderen of blokkeren.
Leden van het Europees Parlement worden gekozen door de volkeren van de lidstaten bij de 4 jaarlijkse Europese Parlementsverkiezingen.

Het dagelijkse bestuur van Europa wordt gedaan door de Europese Commissie waarin Commissarissen zitten die door de nationale regeringen van de lidstaten zijn voorgedragen en benoemd door het Europees Parlement.
Deze worden dus niet door het volk gekozen.

Officieel is de Europese Commissie geen regering maar een "regulerend orgaan" dat "Richtlijnen" uitvaardigt waaraan lidstaten zich moeten houden na goedkeuring door het E.P.
Deze richtlijnen moeten dan door de lidstaten worden omgezet in wetgeving in hun eigen land en taal.

De lidstaten betalen contributie aan de E.G. uit hun nationale belastinginkomsten.
Dus betaal je met je belastingafdracht aan de Nederlandse staat mee aan de contributie voor Europa.

Je kunt wel giften overmaken aan politieke partijen die in het Europese parlement zitting hebben. Deze zijn volgens de ANBI regeling aftrekbaar.

Hier zijn de regelingen omtrent giften omschreven:

http://financieel.infonu.nl/belasting/10877-belastingdienstfiscaal-aftrekbare-giften-inkomstenbelasting.html