Is er een optie om mijn harde schijf in 2 partities te maken om de ene vervolgens met een wachtwoord te beveiligen?

Ja hoor. Je kunt die tweede partitie bijvoorbeeld met Truecrypt beveiligen.

Het partitie systeem zelf kent geen mogelijkheden tot beveiligingen met wachtwoorden ed.

Je kunt in principe best een partitie van een wachtwoord voorzien net als dat je een map van een wachtwoord kunt voorzien maar dat moet dan wel dmv een programma die dan de toegang regelt.
Windows heeft daar ook voorzieningen voor echter enkel op basis van gebruikers rechten. Het blijft ook vrij eenvoudig te omzeilen. Hang zo'n HD in een ander systeem en je kunt er weer gewoon bij.

De enige andere mogelijkheid is om met encryptie te werken. Dan wordt dus alle data versleutelt opgeslagen. Ik denk dan aan Blowfish hoewel ik niet weet of dat nog steeds zo populair is als toen ik daar jaren terug me eens een beetje in verdiept heb.
http://www.schneier.com/blowfish-products.html

Ik kom ook bij TrueCrypt uit.
http://www.truecrypt.org/
http://www.ehow.com/how_7160172_password-protect-hard-disk-partition.html